临床所用的每项检查的临床意义不同，胃镜为食管、胃、十二指肠疾病最常用和最准确的检查方法；检查胃病，若为胃炎则需要做血常规、大便常规、粪便隐血试验、粪便细菌培养、幽门螺旋杆菌检测、胃钡餐X线造影检查等；若为胃溃疡及胃癌，则应在上一检查内容加粘膜活检、肿瘤标志物；若为胃食管反流性食管炎，则加查24小时食管pH监测、食管X线钡餐、食管测压等。检查胃病除了胃镜之外，主要还有以下几种方式：首先是医生的体格检查；其次是B超，内镜超声也很重要，B超通常是在体外做，此处所指的是在胃镜镜头进入体内后，对胃壁做B超，从而了解胃部的症状，以便做出诊断；最后是CT，做CT可以观察胃壁的增厚或者其他病变。胃的检查方法主要是胃镜，看的清楚，诊断准确率高。其他的还有上消化道造影，就是俗称的喝白糊糊，诊断率稍差些。B超检查现在主要是胃肠造影，也是需要造影剂，只能对肿瘤等少数疾病能诊断。胃镜是胃病检查最主要、最基本的项目，除此以外，胃病检查项目还包括上消化道造影、新型磁控胶囊内镜，此类项目在一定程度上可以替代胃镜，避免插管的痛苦。如幽门螺杆菌检测碳呼气试验、幽门螺杆菌抗体独立分型、胃分泌功能检查，均为胃镜的替代和补充，医生会根据患者的具体情况，合理安排检查项目。另外，胃镜检查时应注意空腹，无痛胃镜还需家属陪同。
